https://caotianyu0427.github.io/zh/tags/qpcr/QPCRHugoBlox Kit (https://hugoblox.com)zh-HansSun, 01 Jun 2025 00:00:00 +0000https://caotianyu0427.github.io/media/icon_hu_702a800cd775dbac.pnghttps://caotianyu0427.github.io/zh/tags/qpcr/https://caotianyu0427.github.io/zh/project/juncforge/Sun, 01 Jun 2025 00:00:00 +0000https://caotianyu0427.github.io/zh/project/juncforge/<h2 id="简介">简介</h2> <p>JuncForge 是一个计算流程，用于设计跨越隐秘外显子（CE）剪接连接处的 qPCR 引物对，适用于 RNA 剪接研究，包括 TDP-43 功能缺失与神经退行性疾病中隐秘外显子纳入等相关课题。</p> <h2 id="主要功能">主要功能</h2> <p>给定标注了内含子中隐秘外显子的 GenBank 文件，流程将：</p> <ol> <li>定位 CE 特征及其左右连接处</li> <li>通过 Primer3 设计满足连接处跨越约束的引物对</li> <li>对基因组与 RefSeq mRNA 进行 pair-wise BLAST 筛选</li> <li>保留预期仅扩增含 CE 转录本的引物</li> </ol> <h2 id="技术栈">技术栈</h2> <p>Python、Primer3、BLAST</p> <h2 id="链接">链接</h2> <ul> <li>GitHub: </li> </ul>